Heptad repeat

 Heptad repeat

1. 정의

헵타드 반복구간(Heptad repeat)은 구조적 모티프(structural motif)의 일종으로, 7개의 아미노산 잔기가 반복해서 나타나는 패턴을 일컫는다.

2. 모양새

헵타드 반복구간은 아래와 같이 7개의 염기 서열이 반복적으로 나타나는 구조이다.

H P P H C P C

a b c d e f g

각각의 염기 서열이 나타내는 아미노산 잔기는 다음과 같다.

H: 소수성(hydrophobic) 잔기

P: 극성(polar), 친수성(hydrophilic) 잔기

C: 전하를 띤(charged) 잔기

7개의 위치를 소문자 a부터 g를 이용해서 표기하는 것이 일반적이라고 한다.

3. 이러한 구조가 왜 중요한가

이러한 모티프들은 대다수의 coiled coils에서 기본적으로 나타나는 양상을 보인다. 특히 류신 지퍼(leucine zippers)와 같은 구조에서는 헵타드 반복구간의 d 위치에 류신(leucine)이 대부분을 차지할 정도로 많이 등장한다. 

Coiled coil은 alpha-helices 처럼 꼬인 구조를 가진 아미노산 서열이 다른 alpha-helice와 다시 더 큰 축으로 꼬인 모습을 일컫는다. 이 구조는 gene expression의 조절에서 매우 중요한 생물학적 기능을 담당한다.