Heptad repeat
정의
헵타드 반복구간(Heptad repeat)은 구조적 모티프(structural motif)의 일종으로, 7개의 아미노산 잔기가 반복해서 나타나는 패턴을 일컫는다.
모양새
헵타드 반복구간은 아래와 같이 7개의 염기 서열이 반복적으로 나타나는 구조이다.
H P P H C P C
a b c d e f g
각각의 염기 서열이 나타내는 아미노산 잔기는 다음과 같다.
H: 소수성(hydrophobic) 잔기
P: 극성(polar), 친수성(hydrophilic) 잔기
C: 전하를 띤(charged) 잔기
7개의 위치를 소문자 a부터 g를 이용해서 표기하는 것이 일반적이라고 한다.
이러한 구조가 왜 중요한가
이러한 모티프들은 대다수의 coiled coils에서 기본적으로 나타나는 양상을 보인다. 특히 류신 지퍼(leucine zippers)와 같은 구조에서는 헵타드 반복구간의 d 위치에 류신(leucine)이 대부분을 차지할 정도로 많이 등장한다.
Coiled coil은 alpha-helices 처럼 꼬인 구조를 가진 아미노산 서열이 다른 alpha-helice와 다시 더 큰 축으로 꼬인 모습을 일컫는다. 이 구조는 gene expression의 조절에서 매우 중요한 생물학적 기능을 담당한다.